看你用什么系統來查重了，如果用學術查重cnkivip.net來檢測的話建議不要刪除參考文獻，不過只要格式對的話學術查重也不會去查重參考文獻的。

一般學校都是看總文字復制比的，論文的“總文字復制比”包括【抄襲+引用】綜合。不管你標注引用還是不標注引用都算入總抄襲率的。

不會的。查重的時候 引用部分不是你標出引用就算為引用的，而是看你那一句話是否都是照搬的某篇文章，全部照搬則為引用（標為綠色），稍有改動則是復制（標為紅色）